成都中醫藥大學等:基于数据挖掘和網络藥理學的中醫藥治療肺结節...

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肺结節（pulmonary nodule ，PN ）是经影象學查抄肺部存在直径≤3 cm 的局灶性、类圆形暗影，可高發或伶仃存在，但不伴随肺不张、肺門淋凑趣肿大及胸腔积液等的一種疾病 [1] 。跟着胸部CT 技能的前進與康健體检的普及，肺结節检出率逐年增高。更首要的是，肺结節已成為肺癌診治前移的關頭端口 [2] ，严酷把控肺结節的早診早治對付改良肺癌患者预後和低落灭亡率具备首要意义。但是，現行肺结節的西醫診療计谋以“随访- 监测”為主，不但缺少有用的干涉干與辦法，且轮回来去的過分診療乃至會延续加剧患者的生理和经濟包袱 [1,3-6] 。比年来，大量临床@钻%8N439%研已證%G766y%明@中醫藥在肺结節防治中療效切當且具备怪异上風 [7-13] ，但因為中藥复方成份的繁杂性和藥效物資根本及份子機制的散在性，限定了從中醫視角下對肺结節的临床干涉干與计谋要點和診療系统構成的體系性再熟悉。本钻研拟结合数据發掘和收集藥理學综合阐發中醫藥醫治肺结節的临床用藥纪律，深刻探讨焦點藥物组合醫治肺结節的潜伏靶點與機制，以期為肺结節的临床診治及辦理供给科學根据。

1質料與法子

1.1文献检索與收拾

经由過程计较機检索中國知網（CNKI ）、万方数据库（Wanfang ）、维普数据库（VIP ）、中國生物醫學文献数据库（Sinomed ）、PubMed 等数据库，采集中藥或中成藥醫治肺结節的文献，说话種类限制為中文與英文。经由過程主题辞與自由词連系的方法對检索词举行限制，以“中醫”“中藥”“中醫藥”“中治療療”“論治”“肺结節”為检索词检索中文数据库，以“medicine, Chinese traditional ”“pulmonary nodule ”等检索词检索英文数据库，检索年限為建库至2021 年11 月。

文献纳入尺度：（1 ）中藥或中成藥醫治肺结節合适《肺结節診治中國專家共鸣（2018 年版）》診断尺度；（2 ）藥物構成及临床療效切當，且不结合其他醫治手腕的临床钻研、名老中醫履历、病案阐發等类型的文献；（3 ）不限制藥物剂型、剂量和醫治療程等用藥方法。文献解除尺度：（1 ）醫治肺结節病的相干文献主题或疾病觀點與肺结節相混同；（2 ）理論探究、综述與體系評價、動物实行钻研等钻研类型文献；（3 ）利用中藥外治法、结合化學藥或其他非中藥醫治、藥物記实不@明%l5U4G%白或钻%8N439%研@单味中藥的文献。

1.2創建处方数据库

應用Endnote X20 軟件举行文献辦理和體系查重，经由過程浏览標题、擇要和全文肯定终极纳入文献。3 名钻研者按照纳排尺度自力挑選文献、提取数据，反复的文献及处方只纳入1 次，碰到不同時组内會商或由第4 名钻研者举行判决。應用Microsoft Excel 2019 創建肺结節处方数据库，并對文献所说起肺结節类型與相干查抄成果举行摘录。参考《中國藥典》2020 年版和《中藥大辞典》第2 版，對中藥名称举行規范化处置，如将“半夏”“法半夏”“清半夏”“姜半夏”同一規范為“半夏”；“天龙”同一規范為“壁虎”等；若仅因炮制法子或產地分歧而存在较大藥性差此外中藥予以保存，如“地黄”與“熟地黄”；為令数据更具典范性，去除對性味的修遁词，如微苦、微寒同一為苦、寒。

1.3数据阐發

将規范化後的肺结節处方数据库中的中藥处方数据导入R 说话（3.6.3 版本）举行藥物和性味归经频次阐發、高频藥物联系關系法则阐發、體系聚类阐發，并实現可視化。操纵base 包中的table 函数举行频数统计；操纵dplyr 包中的arrange 函数将藥物、四气、五味、归经别离按频数举行排序并操纵fmsb 包中的radarchart 函数绘制雷达圖；操纵arules 包中的apriori 函数举行联系關系法则阐發，支撑度（support ）暗示两者同時在整體中呈現的几率；前者呈現的环境下後者呈現的几率以置信度（confidence ）暗示，用符号=> 暗示；晋升度（lift ）则代表在含有前者的前提下，且同時含有後者的几率，晋升度＞1 為有用的强联系關系法则，而晋升度越高阐明该藥對存在的靠得住性越强。操纵base 包中的sort 函数将藥對依照支撑度举行排序并操纵circlize 包中的chordDiagram 函数绘制弦圖；操纵stats 包中的hclust 函数实現聚类算法，操纵factoextra 包中的fviz_dend 绘制树状圖。将焦點藥物组合输入TCMSP 平台（ ），以口服生物操纵度（oral bioavailability ，OB ）≥30% 為前提，而且合适类藥性（drug-likeness ，DL ）≥0.18 举行挑選，获得活性成份举行汇总，以後操纵Uniprot 数据库（ ），挑選人类（homo sapiens ）靶卵白，并校订靶標卵白所對應的基因名称，去重後汇总相干靶點。以疾病名称“pulmonary nodule ”為關頭词，别离经由過程Gencards （. org ）、OMIM （ ）、KEGG （http:// www.kegg.jp/ ）等数据库举行疾病靶點基因的检索及挑選，归并後再去重，获得肺结節的疾病靶點。操纵R 说话ggplot2 包绘制韦恩圖，获得焦點藥物组合與肺结節靶點的交集，即焦點藥物组合醫治肺结節的潜伏感化靶點。将潜伏靶點导入STRING 11.0 数据库（ ），選擇“multiple proteins ”後，将生物種类设定為“homo sapiens ”，且最小相互感化得分设定為highest confidence ＞0.9 ，其他参数则選擇默许设置，获得卵白質- 卵白質互相感化（protein-protein interaction ，PPI ）收集模子并暗藏遊离節點，将此成果导入Cytoscape 3.7.2 ，基于Network Analyzer 东西阐發交集靶點的收集拓扑性子参数，包含自由度（degree ）、介度（betweenness centrality ）和慎密度（closeness centrality ）等，举行收集拓扑阐發，記实卵白間互相感化类型及得分，構建PPI 收集圖。應用DAVID （ ）数据库對焦點藥物组合醫治肺结節的靶點举行基因本體論（gene ontology ，GO ）和都門基因與基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes ，KEGG ）富集阐發，设定生物種类為“homo sapiens ”，GO 和KEGG 阐發成果均以 P ＜ 0.05 表白差别具备统计學意义， P ＜ 0.01 伊莉影片區,则阐明有顯著统计學意义。并经由過程 Cytoscape 3.7.2 将中醫藥醫治肺结節焦點藥物组合的活性成份、潜伏靶卵白及 KEGG 通路注释文件汇总收拾到 Excel ，导入 Cytoscape 3.7.2 中構建“中藥活性成份 - 靶點 - 疾病多通路”收集圖，举行收集拓扑阐發。

1.4份子對接验證

将PPI 收集中自由度值排名前5 的關頭靶點與度值最高的3 個重要活性成份别离举行份子對接，以验證成份- 靶點之間的連系可能性。從RCSB PDB 数据库（ ）和TCMSP 获得靶點與成份的三维布局和化學布局，操纵AutoDock Tools 1.5.6 軟件對中藥關頭活性成份和焦點靶點举行份子對接验證阐發，對接後應用PyMOL 軟件举行可視化处置。

2成果

2.1中泡泡面膜,藥复方的采集與挑選

開端检索文献总计1222 篇，严酷按照纳排尺度举行筛查，终极纳入文献39 篇，挑選出醫治肺结節的处方53 首，并構建肺结節处方数据库。详细文献挑選和数据库構建流程見圖1 。

2.2中藥醫治肺结節的四气、五味、归经频次阐發

经由過程Microsoft office Excel 2019 對数据举行規范化後，获得中藥213 味，用藥频次总计914 次，22 味高频（频次≥10 ）中藥利用至多的是甘草39 次（69.64% ）、半夏29 次（51.79% ）、茯苓26 次（46.43% ），其频次散布與藥物種别見表1 。213 味中藥的藥性以寒為主（359 次，52.58% ），温（251 次，27.46% ）、平（229 次，25.05% ）次之。藥味以苦味和甘味為主，此中苦味452 次（30.85% ），甘味451 次（30.78% ）。归经以归肺经（541 次，23.77% ）、脾经（364 次，15.99% ）、肝经（347 次，14.25% ）、胃经（321 次，14.10% ）至多，見圖2 。

2.3醫治肺结節的中藥组方联系關系法则

操纵Apriori 函数對213 味中藥举行联系關系法则阐發，發掘醫治肺结節的高频藥物组合，将最小支撑度设置為0.12 ，最小置信度设置0.8 ，共获得焦點藥對组合38 個，包括中藥15 味。38 個焦點藥對组合的统计成果按支撑度排序，排名前3 的藥對為“半夏=> 甘草”（支撑度0.43 ）、“茯苓=> 甘草”（支撑度0.39 ）、“半夏，茯苓=> 甘草”（支撑度0.30 ），見表2 、3 。應用R 说话circlize 包對二项联系關系法则举行可視化（圖3 ），圆上两點的連線来暗示2 味藥的联系關系性，箭頭由前项藥物指向後项藥物，連線的宽度暗示支撑度。

2.4中藥复方體系聚类阐發

利用R 说话對37 味高频中藥（频次≥8 ）举行體系聚类阐發，怀抱區間采纳Euclidean 間隔，聚类法子為ward.D2 法，聚类数（ k ）取7 ，获得6 组多味藥物组合和1 组藥對，見圖4 。C1 类：白術、茯苓、陈皮；C2 类（藥對）：甘草、半夏；C3 类：桔梗、黄芩、紫菀、桑白皮、苦杏仁；C4 类：白花蛇舌草、半枝莲、白芍、枳实；C5 类：北沙参、鳖甲、麦冬、瓜蒌、玄参、党参、金荞麦、桃仁、薏苡仁、山慈菇；C6 类：浙贝母、黄芪、牡蛎；C7 类：僵蚕、太子参、莪術、川芎、夏枯草、當归、玄参、柴胡、枳壳、郁金。體系聚类所得的7 個聚类组合整體均為扶正祛邪、调畅气血的组合，扶正以补气為主，祛邪以化痰散结為主；表現了肺结節虚实混合、气血湿痰阻滞的根基病機。

2.5靶點展望

2.5.1藥物及肺结節相干靶點的挑選 综合藥物频次阐發、联系關系法则阐發、聚类阐發成果，肯定“甘草 - 茯苓 - 半夏”為焦點藥物组合，以 OB ≥ 30% ， DL ≥0.18 為挑選前提，共获得焦點藥物组活性成份1991 個，甘草、茯苓、半夏的活性成份别离為1769 、35 、187 個。靶點展望發明，甘草238 個、茯苓25 個、半夏110 個，去除反复靶點後共得到253 個。经由過程GeneCards 、OMIM 数据库检索归并及删除反复靶點後，共得到779 個肺结節相干首要靶點。

2.5.2焦點藥物组合醫治肺结節相干靶點的展望 将焦點藥物组合活性成份靶點與肺结節靶點举行映照，得到甘草、茯苓和半夏醫治肺结節的85 個潜伏 靶點，應用R 说话ggplot2 包以韦恩圖的情势展現，見圖5 。将焦點藥物组合“甘草- 茯苓- 半夏”與肺结節交集靶點上傳至STRING 数据库举行PPI 阐發，获得中藥活性成份感化于肺结節的PPI 收集，成果顯示85 個靶標構成的收集中共存在362 项互相感化，均匀局部聚类系数為 0.511 ， PPI 富集 P 值＜ 1.0 ×10 − 16 。将成果导入Cytoscape 3.7.2 軟件，操纵Network Analysis 構建高可托度PPI 收集（色彩越方向暖色，暗示首要性越大），如圖6 所示。成果示收集中各節點的自由度、介度、中間度均跨越均匀值的靶點有17 個，均匀度值8.938 。以節點度值為評價参数，節點度值越大阐明其在PPI 收集中越首要，可能在阐扬生物學功效中起偏重要的感化。自由度排名前10 （自由度娛樂城賺錢,值≥21 ）的靶點為旌旗灯号转导和转录激活因子3 （signal transducer and activator of transcription 3 ，STAT3 ）、Jun 原癌基因（Jun proto-oncogene ，JUN ）、卵白激酶B1 （protein kinase B1 ，AKT1 ）、白细胞介素6 （interleukin 6 ，IL6 ）、酪氨酸激酶 3 （ mitogen-activated protein kinase 3 ， MAPK3 ）、MAPK1 、肿瘤坏死因子（tumor necrosis factor ，TNF ）、肿瘤卵白P53 （tumor protein P53 ，TP53 ）、MAPK14 、Fos 原癌基因（Fos proto-oncogene ，FOS ），表白這些基因在收集中盘踞首要职位地方，提醒這些靶點多是“甘草- 茯苓- 半夏”醫治肺结節阐扬成果的關頭靶點。見表4 。

2.5.3焦點藥物组合醫治肺结節相干靶點的GO 功效與KEGG 通路富集阐發 GO 功效阐發重要用于描写基因靶點的功效，包含生物進程、细胞组分和份子功效。KEGG 富集阐發可以获得焦點藥物组合“甘草- 茯苓- 半夏”醫治肺结節的靶點所富集的關頭通路。将上述焦點藥物组合醫治PN 的共有靶點举行GO 富集阐發，设定 P ＜0.01 ，毛病發明率（false discovery rate ，FDR ）＜0.01 ，拔取 P 值排名前10 的功效信息，经由過程R 说话clusterProfiler 包举行数据收拾，并應用ggplot2 包對成果可視化，見圖7 。富集比力较着的前10 個生物進程包含：DNA 連系转录因子活性的调控（regulation of DNA-binding transcription factor activity ）、上皮细胞增殖（epithelial cell proliferation ）、卵白質定位創建的正向调控（positive regulation of establishment of protein localization ）、對脂多糖的應對（response to lipopolysaccharide ）、對细菌源份子的應對（response to molecule of bacterial origin ）、卵白質转运的正向调理（positive regulation of protein transport ）、對氧化應激的反响（response to oxidative stress ）、细胞因子發生的正调控（positive regulation of cytokine production ）、對活性氧代谢進程的调理（regulation of reactive oxygen species metabolic process ）、细胞對生物刺激（cellular response to biotic stimulus ）的反响進程；富集比力较着的前10 個细胞组分包含：核染色質（nuclear chromatin ）、转录因子复合體（transcription factor complex ）、RNA 聚合酶II 转录因子复合物（RNA polymerase II transcription factor complex ）、核转录因子复合體（nuclear transcription factor complex ）、膜筏（membrane raft ）、膜微域（membrane microdomain ）、膜區（membrane region ）、水泡腔（vesicle lumen ）、膜小凹（caveola ）、質膜筏（plasma membrane raft ）；富集比力较着的前10 個份子功效包含：细胞因子受體連系（cytokine receptor binding ）、细胞因子活性（cytokine activity ）、受體配體活性（receptor ligand activity ）、DNA 連系转录激活剂活性及RNA 聚合酶II 特异性（DNA-binding transcription activator activity ，RNA polymerase II-specific ）、磷酸酶連系（phosphatase binding ）、發展因子受體連系（growth factor receptor binding ）、卵白磷酸酶連系（protein phosphatase binding ）、發展因子活性（growth factor activity ）、泛素样卵白毗連酶連系（ubiquitin-like protein ligase binding ）、卵白丝氨酸/ 苏氨酸激酶活性（protein serine/threonine kinase activity ）。经由過程DAVID 数据库举行KEGG 通路功效富集阐發，并经由過程R 说话ggplot2 包实現可視化做圖。富集比力较着的前10 個通路包含：糖尿病并發症的晚期糖基化终產品及其受體（advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products ，AGE-RAGE ）旌旗灯号通路、查加斯病（Chagas disease ）、乙型肝炎（hepatitis B ）、卡波濟赘瘤相干疱疹病毒傳染（Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection ）、癌症中的卵白多糖（proteoglycans in cancer ）、辅助性T 细胞17 （T helper 17 ，Th17 ）细胞分解（Th17 cell differentiation ）、人类大小胞病毒傳染（human cytomegalovirus infection ）、MAPK 旌旗灯号通路、IL-17 旌旗灯号通路、耶尔森氏菌傳染（Yersinia infection ）（表5 、圖8 ）。

2.5.4中藥活性成份- 靶點- 疾病通路收集圖 将焦點藥物组合“甘草- 茯苓- 半夏”的活性成份、靶卵白及KEGG 通路文件用Cytoscape 3.7.2 軟件構建中藥活性成份- 靶點- 疾病多通路收集圖，見圖9 。應用Network Analyzer 阐發收集拓扑性子，该收集共有2121 個節點，38 個活性成份及1034 個靶點節點，共有1916 条邊，成果顯示度值大于均匀值的前6 位（度值＞20 ）活性成份重要有槲皮素（quercetin ，MOL000098 ）、山柰酚（kaempferol ，MOL000422 ）、黄芩素（baicalein ，MOL002714 ）、柚皮苷（naringenin ，MOL004328 ）、常春藤素（hederagenin ，MOL000296 ）、消旋卡订婚碱（cavidine ，MOL002670 ），見表6 。是以可以展望槲皮素（quercetin ）、山柰酚（kaempferol ）、黄芩素（baicalein ）等為中醫藥醫治肺结節的重要有用成份，這些有用成份具备断根自由基、按捺炎症反响、抗病毒、抗肿瘤活性，改良局部微轮回和养分供應，及防治心脑血管疾病、预防癌症等感化。

2.6份子對接验證

操纵AutoDock Tools 1.5.6 對接东西對PPI 收集中排名前5 的關頭靶點與度值最高的前3 個重要活性成份举行半柔性對接，以連系能暗示小份子與靶卵白連系的好坏，連系能计较成果如表7 所示。凡是連系能小于0 代表小份子與靶卵白可自由連系，當連系能≤ −5.0 kcal/mol ，提醒對接靶點與成份間结 合性较好。表7 中93.33% 的連系能小于 −5.0 kcal/mol ，在必定水平上验證成份- 靶點之間的連系活性。成果中黄芩素（baicalein ）與MAPK3 展現出最佳的連系性，見圖10 ，左圖為总體視圖，右圖為局部視圖，圖中蓝紫色為小份子，淡青色為卵白，黄色虚線暗示氢键感化，灰色虚線暗示疏水感化。

3會商

今朝，利用低剂量计较機断层扫描（low dosage computerized tomography ，LDCT ）举行初期診断是 低落肺癌灭亡率的重要计谋和最有用法子。但必要注重的是，肺结節的初期临床表示不较着，且缺少有用的醫治手腕，對付CT 筛查成果為良性肺结節的患者，临床上多以“随访- 监测”為主，但轮回来去的筛查模式無形中進一步加剧了患者的發急抑郁情感和经濟包袱。分歧醫家基于中醫動态觀與总體觀的防治理念，针對肺结節患者分歧阶段的需求采纳分歧醫治思绪并调解配伍用藥，堆集了丰硕的肺结節醫治履历，亦為肺结癌转化的永劫性空窗期缺少有用干涉干與辦法供给了充沛的临床證据。但是，因為缺少對临床療效與理法方藥間感化瓜葛的详细論述，未能将肺结節的病因病機熟悉與组方用藥履历举行有用转化，因此中醫藥醫治肺结節的临床履历還没有構成體系性的診治理念，而基于数据發掘法子和現代化的生物信息學技能無疑為高效提取并处置中醫藥診治肺结節相干钻研中分歧進程與阶段的信息供给了有用手腕。

值得一提的是，虽然既往有一项雷同钻研基于数据發掘開端摸索了中醫藥醫治肺结節的遣方用藥纪律 [14] ，但必要指出的是该钻研混同了“肺结節”與“ 肺结節病”。详细来講，肺结節病是一種病因未明的多體系多器官的肉芽肿性疾病 [15] ，常加害肺、两侧肺門淋凑趣、眼、皮肤等器官，凡是會有结節性红斑、雙肺淋凑趣肿大、枢纽關頭炎、肌心痛、發热等典范的临床症状表示；而肺结節则重要根据影象學表示举行診断，其临床症状不较着，無特异性症状與體征。更首要的是，有需要在發掘遣方用藥纪律的根本长進一步深刻摸索藥理學機制和生物信息學根本，以期為後续的中醫藥干涉干與肺结節临床钻研與根本实行供给参考。

既往定性文献总结表白，現代醫家多将肺结節的病因病機 [16-24] 归于气滞痰瘀、虚实混合，由正气不足、外邪入侵，致使血疲、气滞、痰浊而發生结節；故以化痰活血、通络散结為根基治法，兼以顾護正气、调畅气機。本钻研成果契合了古今醫家對肺结節“虚实混合、气血湿痰阻滞”病機及以“化痰活血、通络散结為主，分身肺脾之气”為根基治则治法的临證熟悉。起首，肺结節中藥复方性味归经统计成果顯示，當前临床组方以性寒、味甘苦、归肺经的藥物至多，在此根本上获得藥物利用频次最高的前3 味藥物為“甘草”“茯苓”和“半夏”，這也是联系關系法则中支撑度與置信度最高的藥物组合（晋升度1.36 ）。此中，甘草归心、肺、脾、胃经，可补中益气、祛痰止咳；茯苓归心、肺、脾、肾经，善利 水渗湿健脾；半夏归肺、脾、胃经，可燥湿化痰、消痞散结，善治脏腑湿痰；焦點藥物组合“甘草- 茯苓- 半夏”共奏补脾益肺、化湿祛痰之功。最後，必要指出既往有钻研将甘草視為丹方中和谐诸藥 [25] 的副角，凡是舍去甘草後探讨高频藥物组合。但是，本钻研發明甘草不但是联系關系强度最高和联系關系節點至多的藥物，體系聚类算法将其與化痰藥半夏配合归為C2 藥對，充辩白了然甘草在肺结節的中藥丹方中不但是起到和谐藥性的感化，且現代藥理學表白甘草含有三萜类、黄酮类、多糖类、香豆素类等多種化學成份，具备抗肿瘤、抗菌、抗病毒、抗炎、调理免疫、抗纤维化等多種藥理活性 [26-30] ，是以，焦點藥物组合“甘草- 茯苓- 半夏”醫治肺结節的感化機制與靶點值得進一步钻研。

進一步的收集藥理學成果揭露焦點藥物组合“甘草- 茯苓- 半夏”醫治肺结節的有用成份包含槲皮素、山柰酚、黄芩素等，重要感化于STAT3 、JUN 、AKT1 、IL6 、MAPK3 、MAPK1 、TNF 等關頭靶點。起首，度值最高的有用成份槲皮素在本钻研中的藥物来历是甘草，其是一種自然黄酮类化合物 [31] ，具备断根自由基、抗癌防癌等多種生物活性，可按捺炎症介質天生以影响MAPK 旌旗灯号通路和TNF 旌旗灯号通路等炎症相干旌旗灯号通路，從而按捺氧化應激及炎症反响 [32] 。详细而言，有@钻%8N439%研已證%G766y%明@TNF 在肺结節炎性病變及按捺分散進程中阐扬首要感化 [33] ；MAPK3 则属于丝裂原活化卵白激酶家属，其可经由過程引诱特异性炎症介質、發展因子等與细胞膜受體連系，以激活细胞内MAPK3 旌旗灯号通路，引發细胞增殖和炎症等相干反响，且與肿瘤的產生、成长及侵袭和转移進程紧密親密相干 [34-35] 。山柰酚是一種抗氧化剂，能帮忙避免细胞和DNA 氧化侵害，有助于预防癌症、避免异變，還能晋升癌细胞對化療藥物和抗癌藥物的敏感性，并被認為具备预防動脉硬化的成果 [36-37] 。此外，黄芩素可以或许经由過程断根自由基和抗氧化、按捺α- 葡萄糖苷酶活性、调理炎症细胞因子等路子来调控炎性情况 [38-39] 。關頭靶點中，STAT3 的高表达是患者预後不良的有力展望因子 [40] ，其基因编码的卵白是STAT 卵白家属的成员。STAT 家属成员作為细胞因子和發展因子，被受體相干激酶磷酸化，然後構成同源或异源二聚體，转移到细胞核中，并作為转录激活因子被各类细胞因子和發展因子磷酸化激活 [41] ，包含表皮發展因子受體（epidermal growth factor receptor ，EGFR ）、IL5 、IL6 、肝细胞發展因子（hepatocyte growth factor ，HGF ）、白血病按捺因子（leukemia inhibitory factor ，LIF ）和骨形态產生卵白2 （bone morphogenetic protein 2 ，BMP2 ）。同時，STAT3 基因编码的卵白介导多種不育,基因在细胞刺激下的表达，在细胞發展和凋亡等很多细胞進程中阐扬關頭感化 [42] ，经由過程阻断细胞凋亡和引诱细胞增殖，節制着细胞的增殖和分解，并介入肿瘤的產生和成长。别的，IL6 作為炎症介質，可直接影响炎症相干旌旗灯号通路，以按捺炎症的成长 [43] 。原癌基因 JUN 和 FOS 介入多個基因的转录调理，多種细胞外旌旗灯号可引發其转录激活，節制着细胞的增殖和分解。同時， STAT3 還作為 JUN 、 FOS 的上遊基因，经由過程磷酸化等路子促使 JUN 、 FOS 基因高表达，從而使激活卵白-1 （activator protein-1 ，AP-1 ）高表达，终极鞭策细胞的增殖并按捺细胞凋亡，促使肿瘤的天生 [44] ；另外一方面，在多種肿瘤组织中都存在AKT 卵白的過分表达和活化，AKT1 是AKT 基因的首要亚型之一，已被肯定為癌基因，在多種肿瘤组织中都有 AKT1 基因的扩增，活化的AKT 经由過程阐扬介导细胞發展增殖、细胞侵袭、细胞凋亡等方面的感化 [45] ，介入了多種肿瘤的產生和成长。拔取關頭靶點中的STAT3 、JUN 、AKT1 、IL6 ，與挑選出的關頭有用成份槲皮素、山柰酚、黄芩素举行份子對接验證，成果顯示焦點靶標與關頭化合物連系活性杰出。黄芩素與 MAPK3 的 M125 （蛋氨酸， methionine ， Met ）構成 1 個氢键，與 V100 （缬氨酸， valine ， Val ）、 V56 、 K71 （赖氨酸， lysine ， Lys ）残基形成為了较强的疏水感化。总之，上述關頭基因與肿瘤细胞的增殖、血管天生、侵袭及转移紧密親密相干，在阻延肺结節恶性转化為肺癌中饰演偏重要脚色。

從GO 富集阐發成果来看，焦點藥物组合“甘草- 茯苓- 半夏”醫治肺结節的生物進程重要定位于核染色質、转录因子复合體、RNA 聚合酶II 转录因子复合物、核转录因子复合體、膜筏、膜微域等布局，加入DNA 連系转录因子活性的调控、上皮细胞增殖、卵白質定位創建的正向调控、對脂多糖的應對等遗傳信息处置與旌旗灯号傳导進程；其份子功效介入了细胞因子受體連系、细胞因子活性、受體配體活性、DNA 連系转录激活剂活性及RNA 聚合酶II 特异性、磷酸酶連系等各类信息通報與分化代谢勾當，對生物體内的物資运输、DNA 复制、细胞發展和灭亡等生命勾當具备首要感化，并與肿瘤的產生成长、侵袭、转移、耐藥及预後不良等紧密親密相干。KEGG 旌旗灯号通路阐發顯示，焦點藥物组合“甘草- 茯苓- 半夏”醫治肺结節触及多種癌症通路、凋亡通路和各类经典旌旗灯号通路如Th17 细胞分解、IL-17 旌旗灯号通路和MAPK 旌旗灯号通路等。有钻研表白 [46] ，Th17 细胞對肺癌有促成和按捺的雙向调控感化，與肿瘤微情况和Th17 细胞/ 调理性T 细胞比例失衡有關。一方面，Th17 细胞排泄的IL-17A 介导炎症，同時经由過程储蓄积累细胞因子，促成内皮毁伤、细胞增殖、促成血管天生、按捺肿瘤免疫并增长细胞黏附可介导肿瘤的產生；另外一方面，经由過程排泄特异细胞因子，介导本身免疫反响或趋化效應性T 细胞等方面，在抗肿瘤免疫中阐扬首要感化。IL-17 家属成员（IL-17A 、IL-17B 、IL-17C 、IL-17D 、IL-17E 和IL-17F ）可经由過程其响應受體發出旌旗灯号并激活下流通路 [47-48] ，包含核因子-κB （nuclear factor-κB ，NF-κB ）、MAPK 和CCAAT/ 加强子連系卵白（CCAAT/enhancer binding protein ，C/EBP ），以引诱抗微生物肽、细胞因子和趋化因子的表达，IL-17 旌旗灯号通路能经由過程影响细胞的增殖、促成血管的天生及炎性细胞的汇集和活化等多種機制促成癌症的成长 [49-50] 。“甘草- 茯苓- 半夏”不但可以或许经由過程引诱多種细胞内旌旗灯号通路（包含细胞凋亡和细胞存活和炎症和免疫反响）介入癌症的產生成长過程，還可感化于@關%1wc2g%頭大份%31K52%子@癌症中的卵白多糖，即肿瘤微情况中的多種卵白多糖，触及增殖、黏附、血管天生和转移等在内的肿瘤生物學進程 [51-52] ，终极影响肿瘤希望。据此猜测焦點藥物组合“甘草- 茯苓- 半夏”可能经由過程引诱肿瘤细胞凋亡、加强機體免疫功效、按捺肿瘤细胞血管内皮的增殖和迁徙、按捺肿瘤细胞核酸转录等多種機制醫治肺结節并阻延肺的结癌转化過程。别的，焦點藥物组合“甘草- 茯苓- 半夏”還可经由過程介入调控糖尿病并發症中AGE-RAGE 旌旗灯号通路及其他繁杂通路與卡波濟赘瘤相干疱疹病毒傳染、人类大小胞病毒傳染、乙型肝炎等病毒通路到达醫治肺结節的目標，對付KEGG 富调集果所触及很多条通路與病毒傳染、血管生物學之間的繁杂瓜葛必要基于实行钻研進一步證明。

4结論

本钻研應用数据發掘技能和收集藥理學法子，经由過程對中醫藥醫治肺结節的组方用藥纪律举行多角度阐發與探究，開端明白了現代醫家對肺结節病機的熟悉及相干藥物配伍纪律，進而获得中醫藥防治肺结節的焦點藥物组合，即“甘草- 茯苓- 半夏”；并應用收集藥理學法子展望了“甘草- 茯苓- 半夏”焦點藥物组合醫治肺结節的潜伏靶點、機制通路和生物學進程，经由過程份子對接技能较好地展望和揭露關頭活性成份與靶點之間的三维空間布局和連系活性，為展開临床及根本钻研進一步發掘和摸索切當療效與感化機制供给了数据支持。别的，因為分歧类型或分歧危害分层肺结節不但在影象學等方面存在固有的特性性差别，亦是影响中醫藥干涉干與療效及患者预後转归的首要身分，将来的临床钻研應基于中醫藥辨證施治思惟，针對個别化的疾病分型举行精准化和定量化的多角度分层阐發，以期構成中醫藥防治肺结節的體系性診療系统和充实明白临床干涉干與计谋要點。

长处冲突所有作者均声明不存在长处冲突

参考文献（略）

来 源：董 敬，彭小芸，付 西，任益锋，张龙飞，李林炯，祝 捷，由凤鸣．基于数据發掘和收集藥理學的中醫藥醫治肺结節用藥纪律及感化機制阐發 [J]. 中草藥, 2022, 53(20): 6544-6557 .

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